Pesquisadores da Universidade de Chicago Medicina (UCM) diz a análise do genoma pode ser acelerada com o uso de supercomputadores para fins de investigação biomédica.
A equipe de "adaptado um supercomputador Cray XE6 para alcançar o paralelismo necessário para a análise do genoma concomitante múltipla" para capturar a avaliação mais precisa do seqüenciamento do genoma.
O computador é carinhosamente conhecido como Beagle após o navio que Charles Darwin viajou em quando ele se inspirou para escrever A Origem das Espécies.
De acordo com Elizabeth McNally, professor de medicina da UCM, este movimento em computação poderia "mudar manejo do paciente e, ao longo do tempo, adicionar profundidade para o nosso entendimento das causas genéticas de risco e doença."
A equipe supôs que supercomputador seqüenciamento pode agora tornar-se uma ferramenta de pesquisa que iria aumentar o valor da assistência ao paciente.
McNally disse: "Melhorar a análise através de velocidade e precisão reduz o preço por genoma. Com esta abordagem, o preço para analisar um genoma inteiro é menos do que o custo do olhar, apenas uma fracção do genoma. Nova tecnologia promete trazer os custos de seqüenciamento para cerca de US $ 1.000 por genoma. Nosso objetivo é obter o custo de análise para dentro desse intervalo. "
Os cientistas assumiram que "85% das mutações causadoras de doenças estão localizados em regiões de codificação", com cerca de 15% são identificados como "mutações significativas" que estão localizados em regiões não-codificantes "" que já foram considerados junk DNA.
A equipe de McNally tomou dados de seqüenciamento de serra de 61 genomas. Eles usaram software disponíveis publicamente e só tomou um quarto da capacidade do supercomputador para triturar a informação.
Em essência, o uso de supercomputadores permitiria, por exemplo, 240 genomas de ser completamente sequenciados dentro de um período de 48 horas.
FONTE:
http://OccupyCorporatism.com
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